Visi STAI Ali bin Abi Thalib :
- Menjadi Sekolah Tinggi Agama Islam Unggulan dalam bidang Bahasa Arab, Agama dan Pendidikan Islam.
- Menjadi cikal bakal lahirnya Universitas Islam bermetode salaf di Indonesia.
Misi STAI Ali bin Abi Thalib :
- Menyelenggarakan pendidikan tinggi berbasis Islam bermanhaj salaf
- Mengintensifkan dakwah Islamiyah melalui pengajaran bahasa Arab
- Mencetak generasi serta kader-kader yang berkualitas tinggi dalam aqidah, ibadah dan akhlaq serta ilmu-ilmu Islam lainnya sebagai penerus misi para Nabi dan Rasul terutama di bidang dakwah dan pendidikan.
- Menyiapkan sarjana pendidikan Islam yang unggul yang bermanfaat umumnya bagi masyarakat luas secara legal, formal, diakui dan dibutuhkan masyarakat, lembaga, instansi dan pemerintahan.