Kegiatan Administrasi Akademik di dalam Sistem Kredit Semester diatur dan dilayani secara sentral di tingkat STAI oleh Bagian Administrasi Akademik dan Kemahasiswaan (BAAK). Tugas BAAK adalah sebagai berikut:

1. Menyelenggarakan Ujian Masuk.
2. Melayani pendaftaran ulang mahasiswa dan calon mahasiswa.
3. Mencatat nama staf pengajar sebagai dosen penasihat dan mahasiswa yang dibimbingnya.
4. Menetapkan dan menyusun nomor induk mahasiswa.
5. Membuat dan melayani formulir, kartu, dan surat keterangan untuk mahasiswa.
6. Menyelenggarakan Orientasi Mahasiswa Baru.
7. Mengoordinasikan: Penyusunan jadual kuliah, pengaturan gedung serta lokal perkuliahan, pengaturan ujian dan monitoring presensi mahasiswa dan staf pengajar.
8. Mengumpulkan, mengolah dan menyimpan data pribadi dan data akademik mahasiswa.
9. Mendaftar penulisan Karya Ilmiah/Skripsi.
10. Mendata alumni.
11. Membuat statistik.